Pois é eu testei em ambos ambientes, as aplicacoes de seguranca foram geradas, verifiquei tambem se esta inserindo nas tabelas e esta indo sim, e o fluxo de publicação que eu fiz tambem foi da forma que o Cleyton falou, na minha aplicacao de menu eu nao habilitei segurança, mas em todas as outras sim, por isso o sistema abre a tela de menu mas desabilita todas as outras.
esta tendo algum problema na hora de validar as permissoes e desabilitar as aplicações, o problema é que eu não sei aonde hehe.