Boa Tarde,
Como existem algumas pessoas com problema na geração do Diagrama (recurso do SC V5) no ambiente linux, estou abrindo este tópico para indicar o link que informa a correção para o problema.
http://www.scriptcase.com.br/site/baseknowledge/baseknowledge.php?id_topico=268
A solução para este problema é realizar a instalação do Graphviz no PHP, para a versão do sistema operacional utilizado por vocês.
Rodrigo Lins.