O produto deve ter uma unidade padrão de estoque, a mesma informada no sped fiscal. Caso seja necessário você pode ter mais de uma unidade padrão para o produto mas deverá informar um código diferente ao produto para cada unidade.
A empresa define qual vai se a unidade padrão de determinado produto. Isso não significa que seu fornecedor deva emitir a nota fiscal na unidade padrão do seu estoque e que você seja obrigado e emitir sua nota de venda na mesma unidade padrão de seu estoque.
Para isso, seu sistema deve ter adaptação que atenda tanto na compra como na revenda do produto em unidades diferentes a da sua estocagem e ao dar entrada na nota e atualizar os estoque a conversão deve ser feita, o mesmo para a venda.
Exemplo:
Produto: Fio elétrico.
Você pode estocar em rolos de 30mts, mas vender em rolo ou em metros.
Se seu estoque contem 10 rolos, e você vendeu 15mts, seu estoque deve conter 9,5 rolos de fio. A unidade padrão de estoque não pode mudar, pois você formou a seu sped que em dezembro do ano anterior,
você tinha N quantidades em estoque do produto de descrição: Rolo de Fio Elétrico com 30mts.