Bom dia,
1 - Se for instalar o SC do último release 8.1.017 após a formatação e não estiver utilizando ainda este release, recomendo atualizar o ambiente antes de fazer um backup geral.
2 - Faça um backup geral pelo SC.
3 - Se possível exporte projeto a projeto do SC (Já tive problema para retornar o backup full).
4 - Copie a pasta inteira da Netmake e mantenha ela por bastante tempo.
5 - Precisará gerar uma nova chave do SC, acessando: https://www.scriptcase.com.br/login-cliente
6 - Se o seu servidor de Banco de Dados estiver na mesma máquina, não esqueça de fazer backup do BD também, inclusive copiar a criação das views, recentemente fiz a reformatação da minha máquina fiz tudo isso e esqueci das view que não vão com o backup.
7 - Instale o SC, registre o novo serial e restaure os seus projetos.
8 - Recompile todos os projetos.
9 - Verifique o log do apache (o caminho depende do SO utilizado), pois, eventualmente durante o processo de recompilação pode surgir falta de arquivos e o SC fica lento, mas, não acusa problemas (arquivos .css .png .ico etc).
Espero ter ajudado,
Boa sorte.
Flávio