Acho que o Scriptcase não faz a conexão com o MySQL via named pipe para que possamos acessar um PVA do SPED, por exemplo, SPED-FISCAL,o socket name seria SPEDFISCAL3337, Porta = 3338, usuário e senha =spedfiscal. Se o Scriptcase fizesse isso teríamos, além dos dados, também a estrutura hieraquica própria do SPED. Bom, isso é só a minha impressão, talvez exista uma maneira para esse tipo de conexão. Alguém sabe de alguma coisa a respeito?
O PHP faz?
Se o PHP fizer, basta não usar uma conexão do SC e em vez disso usar uma conexão direta do PHP, agora se o PHP não faz esse tipo de conexão, aí o SC não tem culpa.