Olha só, você esta utilizando qual navegador? Tive uns problemas estes tempos com um sistema, não é desenvolvido com SC, mas é Php, Apache e Mysql. E depois de muito buscar o motivo de o meu micro estar com 100% de uso da cpu vi que era uma atualização do I.E 9. Mandei restaurar o sistema para uma data anterior e não tive mais dores de cabeça.
Outra possibilidade pode ser o seu Mysql ou Apache, tenho um cloud com Centos e esses dias também tive problema no Apache que travava e me consumia todos os recursos do servidor, mysql se tiver alguma conexão que é chamada e não é fechada pode causar este tipo de problema.
Me lembro dessas possibilidades, se lembrar de algo mais posto aqui.