Boa,
Muitas vezes (ou todas) é necessário alterar o arquivo 'default.php' que fica dentro do seguinte diretório do phpmyadmin:
/libraries/config.default.php
Depois que editar busque a linha onde tem o "root" no caso a parte que informa a senha do usuário do mysql, e informe a senha do root nesta parte, salve o arquivo e já estará funcionando.
Espero que consiga. Tem outros softwares muito interessantes, mas o phpmyadmin é uma ferramenta que com sua simplicidade atende muitas das necessidades usuais e além disso é possível colocar em um servidor e acessar sem precisar instalar nada na maquina.
Rodrigo Lins.