Bom Dia,
Só complementando o que o nosso companheiro Robson falou, quando você realiza a publicação "Avançada" é possível definir, para cada publicação, um nome de conexão diferente. Então, já poderá deixar configurado separadamente cada uma das conexões necessárias.
Esta de fato, é a forma mais simples.
Mas, poderia utilizar também a macro sc_change_connection.. não sei como estava tentando, mas só lembrando, que esta macro precisa ser chamada/executada em uma aplicação anterior a que você deseja utilizar.(Por exemplo: aplicação de Login).
Curiosidade: E só uma curiosidade para alguns, na aplicação do tipo controle existe um campo chamadao "Perfil", que no momento que publicar as aplicações ele irá mostrar todas as conexões criadas no PROD em um Combobox(Select) para ser selecionado em qual conexão serão executadas as aplicações... isso em tempo de execução. Não que isto que falei seja a solução para este caso.
Rodrigo Lins.